Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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