Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H2Q13888 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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