Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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