Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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