Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNW1Q13573 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms