Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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