Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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