Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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AP3B2Q13367 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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AP3B2Q13367 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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AP3B2Q13367 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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