Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LCP2Q13094 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms