Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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FOXF2Q12947 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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