Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELP6Q0PNE2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms