Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms