Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EP300Q09472 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms