Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms