Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms