Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms