Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TRIQK-220ENST00000524037 865 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL121845.4-201ENST00000613401 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CIB4-201ENST00000288861 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MS4A6E-201ENST00000300182 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL512635.1-201ENST00000414056 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LINC01099-201ENST00000507011 512 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC103740.2-201ENST00000557900 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 BNIP3P20-201ENST00000604827 578 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC24A5-202ENST00000449382 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 BCL2L15-202ENST00000393316 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms