Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms