Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms