Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms