Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXC5Q00444 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXC5Q00444 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXC5Q00444 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXC5Q00444 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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