Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.2 ms