Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMF1P82094 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms