Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms