Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC13P55735 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC13P55735 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC13P55735 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC13P55735 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC13P55735 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC13P55735 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC13P55735 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms