Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP3P54852 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP3P54852 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms