Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB3P54753 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms