Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KPNA1P52294 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms