Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms