Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms