Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms