Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms