Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
SPRR1AP35321 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms