Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PLNP26678 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms