Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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