Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms