Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms