Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms