Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF888P0CJ79 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF888P0CJ79 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF888P0CJ79 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF888P0CJ79 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZNF888P0CJ79 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ZNF888P0CJ79 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF888P0CJ79 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF888P0CJ79 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF888P0CJ79 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF888P0CJ79 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF888P0CJ79 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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