Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA4P06727 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms