Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPLNO95428 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms