Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NBNO60934 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NBNO60934 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBNO60934 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NBNO60934 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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