Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ARHGEF9O43307 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ARHGEF9O43307 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ARHGEF9O43307 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ARHGEF9O43307 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF9O43307 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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