Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FANCAO15360 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCAO15360 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCAO15360 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCAO15360 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms