Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP290O15078 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP290O15078 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP290O15078 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP290O15078 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP290O15078 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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