Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms