Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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