Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms