Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms