Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms